1% 미세돌연변이 발견, 암·뇌질환 유전자 검사 새 지평 열어

한국보건산업진흥원(원장 이영찬)은 연세대학교 의과대학 김상우 교수 연구팀이 KAIST 의과학대학원 이정호 교수팀과의 공동 연구를 통해 "극소량의 유전자 돌연변이 검출이 가능한 '리플로우(RePlow)'를 자체 기술력으로 개발했으며, 국내 유전자 분석기술의 수준을 세계적으로 입증했다"고 밝혔다. 

최근 유전자 검사는 차세대 염기서열 분석기술(NGS) 개발 등을 통해 비교적 정확히 이뤄져 왔으나, 검사 시 돌연변이가 극소량일 경우 실제 유전자 변이를 찾지 못하거나 변이로 오류 탐지되는 문제 등이 발생해왔다.

본 연구진은 실험진행을 통해 1% 이내로 존재하는 돌연변이도 정확히 발견할 수 있는 유전자 분석 방법 '리플로우(RePlow)'를 개발하고 그 효과성을 입증했다.

연구진은 정확한 검출 성공 여부를 판단하기 위해 표준물질을 직접 제작했고, 비교를 위해 세 가지의 서로 다른 염기서열법으로 실험을 진행했다.

실험결과, 기존 방법으로는 유전자 변이를 효과적으로 찾아낼 수 없음을 증명했으며, 최소 두 번 이상의 반복 실험으로 변이와 오류 탐지(error)를 구별해내는 분석방법을 새로이 개발했다.

리플로우(RePlow)라 명명한 새로운 분석법을 통해, 연구진은 기존 방법에서 나타났던 오류의 99%를 제거할 수 있음을 입증하고 뇌전증 질병에서 기존에 찾을 수 없었던 0.5% 수준의 변이를 성공적으로 발견했다.

▲ 기존 기법 대비 암 관련 저빈도 유전자 변이 검출 성능 비교

연세대학교 김상우 교수는 "유전자 변이 검사 결과는 환자의 치료와 직결되는 문제이므로 조금의 오류도 허용될 수 없다"라며 "향후에도 뇌신경 질환 등 보다 정밀한 검사가 필요한 질병분야를 위해 유전자 분석기술 수준을 향상시켜 나갈 것"이라고 밝혔다.

이번 연구는 보건복지부 보건의료연구개발사업 지원으로 수행됐으며, 과학 학술지 '네이처 커뮤니케이션즈(Nature Communications)' 저널에 3월 5일자로 게재됐다.

* 게재 논문 정보

- 저널명: Nature Communications (IF 12.124)

- 논문명: The use of technical replication for detection of low-level somatic mutations in next-generation sequencing

- 저자정보
(제1저자) 김준호 박사 (연세대학교 의과대학 의생명시스템정보학교실, 현 Harvard 의과대학)
(교신저자) 이정호 교수 (KAIST 의과학대학원)
(교신저자) 김상우 교수 (연세대학교 의과대학 의생명시스템정보학교실)

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